重回过去，再现奇迹。泽塔奥特曼是赛罗奥特曼的徒弟，拥有着和赛罗一样的热心肠，是一位非常积极向上的奥特英雄。而且，泽塔非常崇拜赛罗。赛罗虽然嘴上不承认这个徒弟，但其实心里还是很看好泽塔的。赛罗和他的徒弟泽塔为了守卫家园，主动出击迎战敌人。一场激战过后，泽塔被迫与赛罗分开，独自一人追逐逃跑的怪兽。泽塔抵达地球的时候，遇到了正在战斗的遥辉。两人的相遇，拉开了故事的序幕。

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手！为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特曼、罗索奥特曼、布鲁奥特曼，以及银河救援部队的利布特奥特曼作为辅助。“新世代英雄”与“黑暗军团”之间的战斗即将开始。

本不应该存在的神秘凶恶怪兽宇宙来袭了！赛罗、利布特、泰迦、泽塔、爱迪、麦克斯、梦比优斯、葛雷、帕瓦特、格丽乔等，还有更多的奥特英雄将共同加入战斗，向震撼全宇宙的令人费解的事件发起挑战。然而这一切，只不过是从现在开始的大乱斗的序章而已！浮现的阴谋，交错的故事，暗中活动的黄金巨人的目的究竟是什么？